Biometrical Genetics Workflow (Bioflow)

BioFlow es una herramienta innovadora diseñada para guiar la toma de decisiones en la mejora genética global de cultivos. Esta herramienta permite a los usuarios acceder a métodos para comprender o utilizar fuerzas evolutivas (mutación, flujo génico, migración y selección), como la evaluación genética automática de vanguardia (fuerza de selección) en la toma de decisiones. Diseñada para ser independiente de bases de datos específicas, puede extraer datos de bases de datos fenotípicas y de pedigrí disponibles (EBS, BMS, BreedBase), bases de datos genotípicas (GIGWA) y bases de datos ambientales (NASAPOWER), y realizar procedimientos analíticos.

 

Servidor de Producción de BioFlow

Servidor de Invitados de BioFlow

¿Para quién es esta herramienta?

  • Líderes organizacionales
  • Mejoradores genéticos
  • Genetistas
  • Técnicos

¿En qué contexto es útil esta herramienta?

Esta herramienta está diseñada para centros del CGIAR y los NARS, con el objetivo de estandarizar el análisis de datos en los programas de mejora de cultivos. Cuenta con una interfaz fácil de usar que no requiere conocimientos de programación, lo que hace que el procesamiento de datos sea eficiente y accesible para usuarios que no son programadores.

Los resultados esperados incluyen la estimación precisa de accesiones de mejora utilizando fenotipos, datos de marcadores, QTL y conjuntos de datos climáticos. El software no requiere programación, lo que mejora la accesibilidad para todos los usuarios.

Variaciones, escalabilidad y adaptaciones

BioFlow es altamente versátil y puede ser adaptado por una amplia gama de profesionales en la mejora genética de plantas, desde líderes de programas de mejoramiento hasta asistentes de investigación. La adaptabilidad del software se debe a su capacidad para manejar diversos diseños experimentales y conjuntos de datos, lo que lo hace adecuado para varios programas de mejoramiento, independientemente de su escala.

Para los investigadores que deseen reutilizar o adaptar BioFlow, el único requisito esencial es tener acceso a datos fenotípicos. Esto significa que puede integrarse sin problemas en los flujos de trabajo existentes, ya sea trabajando con ensayos a pequeña escala o con grandes programas de mejoramiento. A medida que más investigadores incorporen BioFlow, su flexibilidad les permitirá gestionar y analizar datos de mejora de manera más eficiente, lo que facilitará una mejor toma de decisiones y acelerará los procesos de mejora genética

Herramientas que a menudo se utilizan junto con esta herramienta

  1. Breeding Management System (BMS)

Este sistema sirve como un centro para la gestión de datos de mejoramiento, lo que facilita la integración de BioFlow y la recuperación de los conjuntos de datos necesarios para análisis adicionales.

Este sistema sirve como un centro para la gestión de datos de mejoramiento, lo que facilita la integración de BioFlow y la recuperación de los conjuntos de datos necesarios para análisis adicionales.

Una herramienta que facilita los análisis genómicos de amplio alcance, complementando las capacidades de BioFlow en la gestión de datos genotípicos para obtener conocimientos más detallados.


Además, BioFlow puede acceder a datos climáticos utilizando la API de NASA POWER, lo que permite a los usuarios incorporar datos ambientales en sus análisis de mejoramiento. Estas integraciones hacen que BioFlow sea una herramienta versátil que puede interactuar con diversas bases de datos y recursos, mejorando la eficiencia general de los programas de mejoramiento de plantas.

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Christian Camilo Cadena

Christian Camilo Cadena

Asociado de Investigación - Análisis de Datos -  Programa de Frijol

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