Fusariose du bananier | l'Alliance de Bioversity International et le CIAT

La fusariose du bananier et son impact

Les bananes figurent parmi les produits de base les plus importants au monde ; toutefois, les exportations ne représentent que 16 % de la production mondiale totale, soit environ 25 millions de tonnes métriques. Les 84 % restants sont consommés localement, principalement par les ménages de petit.e.s exploitant.e.s agricoles et sur les marchés urbains nationaux, ce qui souligne le rôle essentiel de cette culture dans la sécurité alimentaire et les revenus ruraux.

Les cultures de la famille des Musacées, qui comprend les bananiers plantains et les bananiers dessert, sont confrontées à plusieurs difficultés et menaces. Parmi les plus graves figure la maladie dévastatrice transmise par le sol et causée par le champignon Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc), en particulier la race tropicale 4 (TR4), la variante la plus virulente du pathogène. Au cours de la dernière décennie, la TR4 s’est rapidement propagée sur plusieurs continents, affectant gravement les cultures de bananes et menaçant les marchés d’exportation ainsi que la sécurité alimentaire locale. Depuis 2018, le nombre de pays touchés par la TR4 est passé de 16 à 26. Rien qu’en Asie du Sud, on estime que la maladie a détruit plus de 200 000 hectares de plantations de bananiers.

Aux Philippines, des évaluations récentes indiquent qu'environ 15 000 hectares ont été perdus à cause du TR4 ces dernières années, dont près de 73 % appartenaient à de petits exploitants agricoles, ce qui illustre clairement l'impact dramatique de la maladie sur les producteurs les plus vulnérables.

La situation est particulièrement préoccupante en Amérique latine et dans les Caraïbes (ALC), où la maladie a été signalée pour la première fois en 2019. Cette région regroupe les dix premiers pays exportateurs de bananes, et les bananes et plantains sont essentiels à la sécurité alimentaire et à la génération de revenus. La Colombie a été le premier pays d’Amérique latine et des Caraïbes à signaler la présence du TR4 en 2019 , qui s’est désormais propagé dans les départements de La Guajira et de Magdalena, touchant au moins 20 grandes exploitations commerciales destinées à l’exportation. Au Pérou, le TR4 a été signalé en 2021 et touche actuellement plus de 1 000 petits producteurs de bananes biologiques à Piura . Au Venezuela, le TR4 a été détecté en 2023, touchant des plantations dans trois États et cinq municipalités, et il a récemment été signalé dans la province d’El Oro, en Équateur, en 2025.

Répartition de la race tropicale n° 4

Répartition mondiale de la souche TR4 de Foc. (Adapté d’une carte réalisée par ProMusa, 2021). La race tropicale 4 (TR4) de Fusarium oxysporum f. sp. cubense a été signalée ou officiellement confirmée dans les pays suivants : Taïwan, la Malaisie, l’Indonésie, la Chine, les Philippines, l’Australie, le Mozambique, la Jordanie, Oman, le Liban, le Pakistan, l’Inde, le Vietnam, le Laos, la Birmanie, Israël, la Thaïlande, l’île de Mayotte, le Royaume-Uni, la Turquie, la Colombie, le Pérou, le Venezuela, le Népal, l’Équateur et les Comores.

Fusariose du bananier causée par la race tropicale 4

Le champignon Foc possède trois structures de reproduction et de propagation : les microconidies, les macroconidies et les chlamydospores. Ces dernières sont de grosses spores de repos à paroi épaisse qui survivent à des conditions défavorables, en particulier lorsqu’elles sont enfouies dans les tissus végétaux ; le Foc les forme en réponse à des stress tels que, par exemple, l’appauvrissement en nutriments. Cela contribue à la capacité du champignon Foc à survivre dans les sols pendant de nombreuses années, tout comme ses hôtes végétaux alternatifs.

Fusarium wilt tropical race 4 - Fusarium wilt of banana - Alliance Bioversity International - CIAT — Structures reproductrices de Fusarium oxysporum f. sp. *cubense* (Foc). (D'après Blomme et al., 2024).

Fusarium wilt tropical race 4 - Fusarium wilt of banana - Alliance Bioversity International - CIAT - Image 1

Parmi ses variantes, la souche tropicale n° 4 est considérée comme la plus virulente, pouvant potentiellement toucher jusqu'à 80 % de la production mondiale de bananes.

Variétés de bananiers plantains et de bananiers dessert sensibles aux races physiologiques de Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc). Le signe + indique la sensibilité.

Variétés cultivées	Sous-groupe	Génomique de groupe	Image	Course 1	Course 2	SR4	TR4
Gros michel; Criollo; Coco; Banano común; Seda; Cuyaco, Quinientos	Gros michel	AAA		+			+
Manzano; Maçã	Silk	AAB		+			+
Prata ana	Pome	AAB		+			+
Hawaiiano; Huamoa	Maia-Maoli popoulu	AAB		+			+
Guayabo; Comino; Pompo; Palillo; Maqueño; Capirona	Maia-Maoli popoulu	AAB		+			+
Isla; Maritú; Resplandor; Thaiti	Iholena	AAB		+			+
Ducasse; Manzano vietnamita; Karpuravalli; Pisang awak	Pisang awak	ABB		+			+
Cachaco; Popocho; Cuadrado; Rulo; Topocho; Papoche; Chopo; Moko; Cuatro filos; Burro; Sapino; Sapucho; sapo; Zapatito de niño. Thai pera; Mocosa; Mafafo; Guineo cudrado; Burro criollo; Mafufo	Bluggoe	ABB			+		+
Orito; Bocadillo; Bananito; Baby banana; Murrapo; Primitivo; Datil; Dominico; Bizcochito; Pacumutito Moquicho; Ouro banana; Pisang mas; Bocado de reina; Guineo niño.	Sucrier	AA					+
Red banana; Red Dacca; Mata cura; Morado; Mata Borracho; Rojo; Green red; Tafetán rojo; Caribe morado	Red banana	AAA					+
Uganda Plantain (Type French); Dominico	Plantain	AAB					+
Cavendish (Gran nanie, Valery and Williams) Nanica; Brazilian; Jhonson; Guineo Guineo macho; Quinientos; Cambur; Monte cristo; Baxijiao; Chocheco	Cavendish	AAA				+ Subtropics	+

Processus d'infection et cycle de la maladie

Le Foc infecte les tissus vasculaires de la plante hôte du bananier, notamment le xylème et le phloème, comparables aux vaisseaux sanguins chez l’être humain. Il limite ainsi la circulation de l’eau et des nutriments, provoquant finalement le flétrissement et la mort de la plante. Les exsudats racinaires, qui sont des composés organiques ou minéraux sécrétés par les racines de la plante dans le sol, stimulent la germination des structures de propagation du Foc présentes dans le sol, notamment les conidies et les chlamydospores. Les infections commencent généralement dans les racines secondaires et tertiaires, ainsi qu’au niveau des blessures et des ouvertures naturelles des racines.

Après la germination, les hyphes, qui sont des filaments microscopiques du champignon, pénètrent par l’extrémité de la racine, traversent le cortex racinaire et envahissent les éléments vasculaires du xylème. Un réseau d’hyphes, appelé mycélium, produit de nouvelles spores qui germent à leur tour et forment de nouvelles hyphes. Celles-ci envahissent l’ensemble de la tige souterraine de la plante et remontent jusqu’au pseudotronc, formé par l’enroulement de la base des feuilles du bananier.

Le champignon produit de nouvelles spores qui circulent dans la sève de la plante jusqu’à d’autres cellules vasculaires du xylème. Elles y germent et produisent de nouvelles structures fongiques, poursuivant ainsi la colonisation des tissus vasculaires. Ce cycle se répète et entraîne la propagation des structures fongiques dans toute la plante et dans le sol.

Fusarium wilt tropical race 4 - Fusarium wilt of banana - Alliance Bioversity International - CIAT - Life cycle — Cycle de vie de Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc) chez le bananier

(A) Les spores (micro- et macroconidies ainsi que chlamydospores) se trouvent dans le sol ou sur des hôtes alternatifs tels que les mauvaises herbes.

(B) Les chlamydospores germent sous l'effet des exsudats racinaires, et les tubes germinatifs pénètrent dans les racines du bananier.

(C) Le champignon Foc se développe jusqu’au cortex, et le mycélium envahit le système vasculaire.

(D) Des conidies et des chlamydospores sont produites en continu dans les tissus vasculaires. Les conidies se propagent rapidement dans toute la plante via le système de transpiration. Le mycélium et la gomme obstruent les tissus vasculaires, et les premiers symptômes de jaunissement apparaissent sur les feuilles les plus âgées.

(E) Le Foc colonise et détruit davantage de tissus vasculaires, provoquant un flétrissement intense.

(F) La plante infectée meurt, et la plante « suiveuse » (fille), qui a été contaminée par la plante mère via une connexion vasculaire, présente les premiers symptômes. La plante mère finit par tomber, et le cycle de la maladie recommence. (Adapté de Dita et al., 2018).

Symptômes de la maladie

Le symptôme le plus visible est la décoloration et le flétrissement des feuilles, qui finissent par entraîner la mort de la plante. Dans des conditions naturelles, la maladie se manifeste principalement lorsque la plante a entre 5 et 9 mois. Cependant, chez les variétés très sensibles, en combinaison avec certaines conditions du sol, les premiers symptômes peuvent apparaître dès 3 mois après le semis.

Symptômes externes

Jaunissement des feuilles les plus anciennes, partant du bord vers la nervure centrale, avec progression du jaunissement et du flétrissement vers les feuilles les plus jeunes.
Les feuilles flétries s'affaissent progressivement au niveau du pétiole, pendantes du pseudotronc comme une jupe.
Fissure longitudinale à la base du pseudotronc.
La production de feuilles cesse ; celles qui apparaissent sont peu développées et malformées.
Le fruit ne présente aucun symptôme, bien que l'émergence et le développement complet des grappes puissent être affectés.

Chlorose progressive des feuilles, évoluant des stades initiaux vers la nécrose et la mort de la plante.

Fusarium wilt tropical race 4 - Fusarium wilt of banana - Alliance Bioversity International - CIAT - Image 3 — Jaunissement précoce des feuilles

Fusarium wilt tropical race 4 - Fusarium wilt of banana - Alliance Bioversity International - CIAT - Image 4 — Jaunissement avancé des feuilles

Fusarium wilt tropical race 4 - Fusarium wilt of banana - Alliance Bioversity International - CIAT - Image 5 — Plier des draps pour leur donner la forme d'une jupe hawaïenne

leaf necrosis and plant death - Fusarium wilt of banana — Feuilles mortes (Mort de la plante)

Fissuration longitudinale de la pseudotige et déformation des feuilles, accompagnées d'un arrêt de la croissance végétative.

Fusarium wilt tropical race 4 - Fusarium wilt of banana - Alliance Bioversity International - CIAT - Image 7 — Fissuration du pseudotronc

Fusarium wilt tropical race 4 - Fusarium wilt of banana - Alliance Bioversity International - CIAT - Image 8 — Feuilles malformées et arrêt de la production de feuilles.

Les fruits ne présentent aucun symptôme visible, mais les grappes montrent une maturation incomplète et des fruits peu charnus.

Fusarium wilt tropical race 4 - Fusarium wilt of banana - Alliance Bioversity International - CIAT - Image 9 — Grappe dont la levée est incomplète.

Fusarium wilt tropical race 4 - Fusarium wilt of banana - Alliance Bioversity International - CIAT - Image 10 — Grappe difforme, sans chair à l'intérieur.

Symptômes internes

Les symptômes internes, tant au niveau des pseudostames que des cormes, comprennent l'obstruction et la nécrose des faisceaux vasculaires, ce qui empêche la plante d'absorber l'eau et les nutriments.

Obstruction et nécrose des faisceaux vasculaires

Fusarium wilt tropical race 4 - Fusarium wilt of banana - Alliance Bioversity International - CIAT - Image 12 — Nécrose du pseudotronc.

Fusarium wilt tropical race 4 - Fusarium wilt of banana - Alliance Bioversity International - CIAT - Image 11 — Nécrose du bulbe.

Voies de dispersion

La dispersion à longue distance est principalement due à l'intervention humaine, tandis que la dispersion à courte distance peut être liée à la fois à des facteurs humains et naturels, tels que le ruissellement, les déplacements d'animaux, d'insectes et de plantes contaminées. Le champignon Foc est un habitant naturel du sol et peut être introduit dans une exploitation ou une parcelle, ou en être expulsé (figure 8), par les moyens suivants :

Le sol contaminé par le champignon peut être propagé par les chaussures, les outils, les machines agricoles, les véhicules, les eaux de ruissellement, le matériel végétal conventionnel, les substrats et les animaux.
Le matériel végétal a toujours constitué le principal vecteur de propagation de la maladie. Les rejetons ou cormes asymptomatiques issus de plantes mères infectées, qui sont déplacés ou transportés entre différentes régions, entre exploitations agricoles ou au sein d’une même exploitation, puis utilisés pour la plantation, constituent un vecteur d’introduction de la maladie. Les organes végétaux ou les parties de résidus de culture utilisés comme sources de matière organique constituent un risque d’introduction et de propagation de la maladie.
L’eau est un vecteur efficace de propagation de la maladie, car elle peut transporter le sol contaminé par Foc via les rivières, les crues, les canaux, le ruissellement et l’irrigation. Elle peut également transporter des débris ou des tissus provenant de plantes contaminées.
Insectes : des insectes tels que le charançon de la banane (Cosmopolites sordidus) peuvent transporter l’agent pathogène et infecter les plantes.

Fusarium wilt tropical race 4 - Fusarium wilt of banana - Alliance Bioversity International - CIAT - Fig 3 Epidemiology — Facteurs associés à la propagation de l'agent pathogène lors des épidémies de flétrissure causée par *Fusarium* chez le bananier. Première incursion (en haut à gauche). Vecteurs (au centre). Matériel végétal (en haut à droite). Animaux (en haut à gauche). Travailleurs (en bas à gauche). Eau (en bleu). Ces facteurs peuvent agir séparément ou conjointement pour disperser les structures de Fusarium oxysporum f. sp. cubense sur de courtes ou de longues distances. (Adapté de Dita et al., 2018).

Hébergeurs alternatifs

Le Foc peut également survivre au sein d'autres plantes, notamment plusieurs cultures, des mauvaises herbes, des graminées et des plantes ornementales, sans provoquer les symptômes externes caractéristiques de la flétrissure fusarienne. Le cycle de vie du Foc chez ces mauvaises herbes peut différer de celui observé chez les bananiers, bien que l'on sache encore peu de choses sur ces mécanismes à l'heure actuelle.

Hôte alternatif de Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc TR4)

Nom commun	Nom scientifique	Famille	Espèces cultivées	Mauvaises herbes	Graminées	Plantes ornementales	Hôte Foc TR4 (+)
False banana	Ensete ventricosum	Musáceae	x				+
Achira	Canna indica	Cannáceae	x				+
Spreading day flower; Chicken intestine; Canutillo; Everlasting flower; Comfrey with comfrey	Commelina diffusa	Commelinacea		x			+
Purpletop chloris; Indian beard; Goat's beard; Broom	Chloris inflata = Chloris barbata	Poaceae		x			+
Wild poinsettia; Milkman; Swallow and Garden spurge; Chicken intestines	Euphorbia heterophylla and Euphorbia hirta	Euphorbiaceae		x			+
Coat buttons; Bull's herb; Hill rosemary; Buttonwort; Worm-killer	Tridax procumbens	Asteraceae		x			+
Billy goat; Goat's herb; goat; mint; blue celestine; St. John's wort or holy light	Ageratum conyzoideses	Asteraceae

Mesures de biosécurité

L'exclusion et la prévention sont des stratégies qui reposent sur la surveillance phytosanitaire et la mise en œuvre de mesures de biosécurité au niveau national, régional, de l'exploitation agricole ou du champ. L’exclusion au niveau national relève de la responsabilité des ONPV (organismes nationaux de protection des végétaux) qui, dans le cas du Foc TR4, doivent concentrer leurs efforts dans les ports, les aéroports et aux frontières terrestres. La prévention est un concept plus large qui inclut également la diffusion d’informations et la formation des différentes parties prenantes de la chaîne de valeur sur les facteurs de risque liés au FW. L’exclusion et la prévention permettent la mise en place de mesures de biosécurité visant une gestion efficace et opérationnelle de ces risques. Ainsi, des mesures très diverses, telles que le lavage et la désinfection des conteneurs et des véhicules, le contrôle des bagages, le recours à des chiens de détection dressés, l’installation de bains de pieds pour la désinfection des chaussures, la restriction des mouvements de matériel végétal et la sensibilisation des voyageurs par le biais de supports d’information et d’alertes officielles, ont été recommandées et mises en œuvre à des degrés divers.

La biosécurité, comme toute autre pratique de gestion du Foc TR4, doit s'appuyer sur l'épidémiologie de la maladie. Il est donc nécessaire de comprendre les facteurs et les voies de propagation de l'agent pathogène à travers des approches spécifiques à chaque site. Même en cas de phénomènes météorologiques extrêmes, les stratégies et mesures de biosécurité doivent être rigoureusement mises en œuvre et contrôlées. Quelle que soit la taille de l’exploitation ou la situation économique du producteur, les principes de biosécurité doivent faire partie intégrante des activités quotidiennes de l’exploitation (tableau 3).

L’efficacité des mesures de biosécurité dans les exploitations ou plantations bananières dépend de divers facteurs, qui peuvent être regroupés en facteurs biophysiques et socio-économiques. Les facteurs biophysiques peuvent à leur tour être divisés en facteurs contrôlables et incontrôlables.

Facteurs biophysiques contrôlables

Systèmes d'irrigation
La mise en place de zones tampons avec des cultures non-hôtes entre les zones touchées et celles exemptes de maladies peut réduire la propagation des agents pathogènes.

Facteurs biophysiques incontrôlables

Les inondations causées par de fortes pluies sont très fréquentes dans la plupart des régions productrices de bananes. Ces phénomènes ont un impact direct et immédiat sur les plantations, qu’ils détruisent souvent.

Facteurs socio-économiques

L’absence de mise en œuvre des mesures de biosécurité peut dépendre non seulement de leur coût à l’hectare, mais aussi de l’organisation du travail et des pratiques des ouvriers, des routines de gestion des cultures déjà intensives avec des objectifs hebdomadaires (caisses/conteneurs), ainsi que de la disposition contiguë des parcelles et des exploitations sans zones tampons.

Principes de biosécurité pour les exploitations de bananes et de plantains

Mesure	Commentaires
Clôture de la propriété :	Limitez l’accès aux personnes, aux véhicules et aux animaux. L'utilisation de matériaux résistants (bois, fil barbelé, grillage, haies, etc.) est recommandée.
Signalétique relative aux mesures et procédures de biosécurité :	Elle permet de fournir des conseils et des instructions sur les procédures de biosécurité que doivent respecter les opérateurs ou les visiteurs entrant dans l’exploitation. Ces consignes doivent être placées à chaque point de contrôle, en indiquant les mesures à prendre. Des panneaux ou des pictogrammes peuvent être utilisés et doivent être fabriqués dans des matériaux résistants et durables.
Entrée et sortie uniques de la propriété :	Celle-ci doit permettre aux personnes et aux véhicules d’accéder à un point unique d’entrée et de sortie de la propriété et doit être fermée par un portail afin de restreindre l’accès aux lieux. Le portail peut être construit à partir des matériaux suivants : bois, fer, aluminium, fil de fer, etc.
Lavage et désinfection des chaussures, des véhicules et des machines agricoles :	Une zone de lavage et de désinfection doit être disponible. Elle doit être située à la seule entrée de l’exploitation et comporter une surface isolant le sol des pneus du véhicule. Des matériaux isolants tels que le ciment, le gravier lavé ou concassé, ou la pierre concassée peuvent être utilisés. Installez des bains de pieds, qui peuvent être mobiles ou fixes, en béton, en plastique et/ou en aluminium. Mettez à disposition du matériel de nettoyage des chaussures, tel que des brosses, des nettoyeurs mécaniques de bottes et des nettoyeurs haute pression, etc.
Enregistrement et contrôle des accès à l’exploitation :	Informer et former le personnel entrant aux procédures de biosécurité à respecter sur le site. Conserver des informations sur la personne, telles que son origine, les cultures visitées, sa pointure, sa tenue vestimentaire, le motif de sa visite, etc.
Sensibilisation et formation :	Sensibiliser la communauté vivant à proximité de l’exploitation aux mesures de biosécurité mises en place. Former les travailleurs de l’exploitation aux procédures de biosécurité qu’ils doivent adopter dans chacune de leurs tâches quotidiennes.

Détection de la fusariose du bananier causée par la race tropicale 4

La détection précoce du flétrissement fusarien constitue un pilier fondamental pour la prévention, l'endiguement et la gestion efficace de cette maladie chez les Musacées.

Détection sur le terrain

La détection précoce et la destruction des plantes présentant des symptômes de la flétrissure fusarienne sont essentielles pour réussir à endiguer l’agent pathogène et à gérer globalement la maladie. L’objectif principal de cette pratique est de réduire, voire d’arrêter, la propagation de la maladie vers d’autres régions du pays. Plus les plantes infectées sont détectées tôt, plus les chances de contenir efficacement la maladie sont grandes. À cette fin, il est essentiel de surveiller fréquemment les plantations afin de repérer les plantes suspectes. Bien que la flétrissure fusarienne soit une « vieille maladie » dans de nombreuses régions, les agriculteurs ne connaissent pas bien ses symptômes.

Les techniciens et les agriculteurs doivent être formés non seulement à détecter les symptômes du TR4, mais aussi à les différencier de maladies bactériennes telles que le « Moko », causé par (Ralstonia solanacearum raza 2) et la pourriture molle bactérienne (BSR) causée par (Pectobacterium carotovorum / Dickeya paradisiaca), et afin d’identifier la coexistence éventuelle de complexes pathogènes (voir photos). Dans les zones situées en dehors des zones de production de bananes destinées à l’exportation, les souches Foc R1 et R2 sont largement répandues, affectant les variétés locales et provoquant des symptômes similaires à ceux du Foc TR4. Cela pose un défi supplémentaire pour la détection précoce du Foc TR4, car l’agent pathogène peut apparaître dans les variétés locales plutôt que dans la Cavendish. La formation de tous les acteurs de la chaîne de valeur, en particulier ceux travaillant dans la production et le conditionnement, offre une opportunité de surveillance en temps réel pour la détection de la maladie, une option qui est actuellement sous-développée.

Detection of Fusarium wilt tropical race 4 — Co-occurrence du Foc TR4 et de la pourriture molle bactérienne (BSR). Symptômes de Foc TR4 (panneau de gauche), de la pourriture molle bactérienne (panneau du centre) et de la co-occurrence de Foc TR4 et de la pourriture molle bactérienne (panneau de droite) (Adapté de Vargas JE et al., 2024).

Une fois la maladie détectée, un débat s'engage sur l'étendue de la zone à détruire pour la contenir. L'étendue de cette zone doit être soigneusement définie au cas par cas, en tenant compte des scénarios spécifiques à chaque exploitation :

Le Foc TR4 n’est pas présent (A) ;
Le Foc TR4 est un organisme nuisible soumis à quarantaine et une première incursion a été détectée (B) ;
Le Foc TR4 est déjà établi, mais avec de faibles niveaux d’incidence (C) ; et
L’intensité du Foc TR4 est élevée, la maladie est répartie de manière homogène dans toute la plantation et de nouvelles plantes infectées sont détectées périodiquement (D).

Compte tenu de ces différents scénarios, les pratiques de gestion et leur intégration peuvent varier, mais certaines pratiques, telles que celles visant l’exclusion, le confinement, ainsi que l’exclusion et la maîtrise des agents pathogènes et la gestion des sols, s’appliquent à tous les scénarios.

Detection of Fusarium wilt tropical race 4 - Disease_scenarios full — Représentation schématique de quatre scénarios différents de flétrissure fusarienne dans une plantation de bananiers. **(A)** La maladie n'est pas présente. **(B)** L'agent pathogène responsable est un organisme nuisible soumis à quarantaine et une première incursion a été détectée. **(C)** La maladie est établie, mais sa distribution est irrégulière et son incidence faible. **(D)** La maladie est répartie de manière homogène et présente une incidence élevée. (Adapté de Dita et al., 2018).

Détection en laboratoire

La détection et le diagnostic du Foc TR4 reposent sur plusieurs critères complémentaires. Ceux-ci comprennent, au minimum, les symptômes externes et internes observés sur le terrain sur les plantes atteintes, ainsi que la caractérisation en laboratoire de l’agent pathogène, pour laquelle il est important de conserver des isolats de spores individuelles provenant de bananiers présentant des symptômes. Les méthodes moléculaires les plus fiables actuellement disponibles pour caractériser le champignon responsable sont la PCR, la qPCR (souvent soumise à réglementation) et la LAMP (amplification médiée par boucle, pour laquelle il existe des kits commerciaux pouvant être utilisés directement sur le terrain). Cependant, de nouvelles méthodes hautement spécifiques et sensibles sont actuellement en cours de développement, telles que la ddPCR (PCR numérique) et la RPA-CRISPR Cas12a (amplification par recombinase-polymérase). En cas de première détection au niveau national, des interventions rapides et techniques sont recommandées, telles que le diagnostic de la compatibilité végétative (VCG) entre les souches, ainsi qu’un processus de séquençage complet.

Comment lutter contre la race tropicale 4 du Fusarium (Foc TR4) : mesures concrètes

La stratégie de gestion du Foc TR4 dans les systèmes de production bananière doit reposer sur une approche intégrée combinant des mesures visant à exclure l’agent pathogène, à détecter précocement les foyers et à les éradiquer ou les contenir immédiatement, ainsi que la mise en œuvre rigoureuse de protocoles de biosécurité destinés à prévenir sa propagation au sein des exploitations et entre celles-ci. Cette stratégie devrait également inclure l’utilisation progressive de variétés résistantes ou tolérantes, l’intégration d’agents de lutte biologique et l’adoption de pratiques agronomiques visant à améliorer la santé physique, chimique et biologique du sol, à réduire la pression pathogène et à renforcer la résilience du système de production.

Pour réduire le risque que le Foc TR4 pénètre dans les cultures de bananiers et de plantains et s'y propage, veuillez suivre les étapes suivantes :

Surveillez et contrôlez l'accès à votre exploitation agricole des personnes, des animaux, des outils, des véhicules, du matériel, de la terre ou du matériel végétal.
Mettez en place des zones de nettoyage et de désinfection pour les chaussures, les véhicules et toute source susceptible de transporter de la terre. Entrez et sortez après vous être nettoyé.
Assurez-vous que le matériel végétal que vous allez utiliser est certifié sain.
Effectuez une analyse du sol, corrigez son pH pour le porter à un niveau supérieur à 5,6 et assurez-vous que les éléments nutritifs tels que le calcium, le potassium, le phosphore et le zinc sont biodisponibles et présents en quantités suffisantes.
Évitez d’utiliser des sources d’azote à base d’ammonium, telles que l’urée et le sulfate d’ammonium.
Appliquez des micro-organismes dont l’action de lutte biologique est avérée, tels que Trichoderma sp., Bacillus spp., Streptomyces spp. et Pseudomonas spp., entre autres.
Appliquez des amendements organiques tels que du compost, de la matière organique et du biochar autour de la plante.
Veillez à ce que votre exploitation dispose d’un bon drainage.
Surveillez et contrôlez les insectes vecteurs du Foc TR4, tels que le charançon de la banane (Cosmopolites sordidus).
Organisez régulièrement des formations pour les ouvriers agricoles.
Surveillez fréquemment les plantations afin de détecter les plants suspectés d’être atteints par le Foc TR4 et, en cas de suspicion, prévenez les autorités phytosanitaires locales.

Enfin, il est essentiel d’adopter une réponse réfléchie, structurelle et durable face au Foc TR4, en l’intégrant comme une dimension permanente dans les systèmes de production bananière, les programmes des ONPV et les pratiques de biosécurité au niveau des exploitations. Les mesures de quarantaine et de biosécurité doivent être consolidées en tant que composantes d’une gestion continue, tant pour l’exclusion de l’agent pathogène que pour la production en sa présence. Il est également essentiel de renforcer les programmes publics de protection phytosanitaire et de biosécurité tout au long de la chaîne de valeur, en y intégrant des analyses de risques et des approches épidémiologiques qui permettent une efficacité et une efficience accrues à long terme.

Dans ce contexte, chaque pays, avec le soutien de son ONPV, des agences internationales, des mécanismes de coopération régionaux et des programmes de recherche sur la banane, devrait promouvoir des innovations techniquement fiables pouvant être adoptées par les producteurs. Celles-ci devraient viser à :

contenir l’agent pathogène en renforçant les capacités de surveillance et de diagnostic ;
développer et généraliser la culture de variétés commerciales résistantes, grâce à des programmes d’amélioration, d’introduction, d’évaluation et de multiplication du matériel végétal fusariose du bananier;
identification et validation d’organismes de lutte biologique au niveau national ;
mise en œuvre de stratégies de gestion fondées sur l’épidémiologie, élaborées en étroite collaboration avec les producteurs ; et
dispenser une formation phytosanitaire aux acteurs de la filière bananière.

Ensemble, ces actions permettront de passer d’une réponse réactive à un modèle de gestion global et durable du Foc TR4, renforçant ainsi la résilience et la compétitivité du secteur bananier dans la région.

Scénarios et priorités d'action contre le Foc TR4 dans la filière bananière

6. Scenarios and priorities for action against Foc TR4 in the banana agri-food system - Figure 11 — Aperçu de la situation épidémiologique actuelle (lpanneau de gauche), des agriculteurs et des systèmes de production **(panneau de droite)**, des impacts attendus **(panneau du haut)**, et mesures prioritaires (panneau du bas) concernant la flétrissure causée par la race tropicale 4 (TR4) de Fusarium en Amérique latine et dans les Caraïbes. *(Adapté de Munhoz et al., 2024).*

Les efforts de l'Alliance pour comprendre et lutter contre le flétrissement fusarien.

L'Alliance entre Bioversity International et le CIAT est à l'avant-garde de la recherche et de la lutte contre la flétrissure fusarienne du bananier, en particulier la race tropicale 4 (TR4). Depuis son apparition en Amérique latine, l'Alliance a mené des projets dans la région Amérique latine et Caraïbes (ALC) :

Projet ALER4TA : « Innovations pour la prévention du Fusarium TR4 en Amérique du Sud ». (Colombie, Équateur, Pérou et Bolivie) (2022-2024).
Projet de la BID : Élaboration de protocoles régionaux pour la lutte et la prévention de la propagation de la race tropicale 4 de Fusarium chez les musacées (bananiers et plantains) dans les pays de la CAN (Colombie, Équateur, Pérou) (2022-2024).
Projet STC-CGIAR : « Renforcement des connaissances, des capacités de diagnostic et des bonnes pratiques face à la menace du Fusarium et d’autres problèmes phytosanitaires pour les familles productrices de bananes au Pérou » (2020–2022).
Projet STC-CGIAR : Innovations pour la prévention et la gestion de la race tropicale 4 de Fusarium (Foc TR4) dans les cultures de plantains et de bananes au Pérou. (2025-2027).

Parallèlement, l’Alliance encourage la recherche scientifique visant à développer des variétés de bananiers résistantes au TR4. Parmi les activités clés figurent l’évaluation et la sélection de ressources génétiques de bananiers présentant un potentiel de résistance, l’utilisation d’outils de séquençage génomique pour mieux comprendre les mécanismes sous-jacents à la résistance et à la sensibilité, ainsi que le renforcement des programmes de sélection. Ces initiatives s’inscrivent dans le cadre d’une stratégie intégrée de gestion des maladies qui comprend également des recherches visant à améliorer la santé des sols grâce à l’incorporation de micro-organismes bénéfiques et à l’utilisation de cultures de couverture, ainsi que la formation des agriculteurs et la promotion de pratiques agricoles résilientes au changement climatique. Ensemble, ces efforts visent à contribuer au développement d’un système de production bananière plus durable, plus productif et plus résilient, capable de relever les défis phytosanitaires actuels et futurs.

Assistance technique et recherche dans le cadre du programme « Musaceae »

Réponses techniques aux épidémies de Foc TR4
Diagnostic en laboratoire (Moko et Foc TR4)
Formation en présentiel sur la détection, la biosécurité et la gestion préventive du Foc TR4.
Agent d’intelligence artificielle pour la formation de masse aux enquêtes d’analyse des maladies et des risques via (WhatsApp Bot).
Analyse des risques et des plans d’urgence pour d’autres organismes nuisibles soumis à quarantaine (BBTV, XWB)
Détection des maladies grâce à l’IA (application Tumaini et AIR).
Renforcement des capacités en matière de prévention, de détection et de gestion des menaces phytosanitaires liées aux maladies vasculaires (Foc TR4, Moko, pourriture molle bactérienne et autres) des Musacées en Amérique latine et dans les Caraïbes.
Renforcement des capacités techniques des ONPV, des centres de recherche et des producteurs en Amérique latine et dans les Caraïbes.
Études socio-économiques sur les maladies affectant les Musacées.