Flux de travail en génétique biométrique (Bioflow)

• Direction organisationnelle
• Sélectionneur.euse.s
• Généticien.ne.s
• Technicien.ne.s

Cet outil est conçu pour les centres du CGIAR et les Systèmes Nationaux de Recherche Agricole (NARS), afin d’harmoniser l’analyse des données au sein des programmes de sélection végétale. Il dispose d’une interface conviviale ne nécessitant aucune compétence en programmation, ce qui rend le traitement des données à la fois efficace et accessible aux non-spécialistes.

Les résultats attendus incluent une estimation précise des accessions de sélection à partir de données phénotypiques, de marqueurs génétiques, de QTL et de données climatiques. L’absence de codage requis renforce l’accessibilité de l’outil pour tou.te.s les utilisateur.rice.s.

BioFlow est un outil particulièrement polyvalent, pouvant être utilisé par une large gamme de professionnel.le.s de la sélection végétale, des responsables de programmes aux assistant.e.s de recherche. Sa flexibilité repose sur sa capacité à traiter des plans expérimentaux et des ensembles de données variés, ce qui le rend adapté à différents types de programmes de sélection, quelle que soit leur envergure.

Pour les chercheur.e.s souhaitant réutiliser ou adapter BioFlow, le seul prérequis est l’accès à des données phénotypiques. Cela permet une intégration fluide dans les processus existants, qu’il s’agisse d’essais à petite échelle ou de grands programmes de sélection. À mesure que davantage de chercheur.e.s adopteront BioFlow, sa flexibilité leur permettra de mieux gérer et analyser les données de sélection, facilitant ainsi une prise de décision plus éclairée et une accélération des processus de sélection.

1. Système de gestion de l'élevage (BMS)

Ce système sert de plaque tournante pour la gestion des données d'élevage, ce qui facilite l'intégration et la récupération par Bioflow des ensembles de données nécessaires à une analyse plus poussée.

Ce système sert de plaque tournante pour la gestion des données d'élevage.

• Enterprise Breeding System (EBS)

L'EBS est conçu pour les programmes de sélection à grande échelle et fonctionne de manière transparente avec Bioflow pour fournir un accès aux données de sélection au niveau de l'entreprise pour une prise de décision efficace.

• Genotype Investigator for Genome-Wide Analyses (Gigwa)

Un outil qui facilite les analyses à l'échelle du génome, complétant les capacités de Bioflow dans la gestion des données génotypiques pour un aperçu plus détaillé.

De plus, Bioflow peut accéder aux données météorologiques via l’API NASA POWER, ce qui permet aux utilisateur.rice.s d’intégrer des données environnementales dans leurs analyses de sélection. Ces intégrations renforcent la polyvalence de Bioflow, qui peut interagir avec diverses bases de données et ressources, améliorant ainsi l’efficacité globale des programmes de sélection végétale.

Christian Camilo Cadena

Les enfants de l'école sont des enfants de l'école et des enfants de la rue.

Associé de recherche. Analyse de données - Programme Haricot

Consultant.

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