2025 Annual Report Les pays unissent leurs forces contre la maladie du balai de sorcière du manioc
Une maladie dévastatrice des cultures a atteint l’Amérique latine. Nous avons collaboré avec des chercheur.e.s nationaux.ales, des Philippines jusqu’au Brésil, afin de retracer son origine et de ralentir sa propagation.
Dans les champs de manioc de la Guyane française, les agriculteur.rice.s soulèvent des feuilles anormalement immatures et déterrent des racines flétries, impropres à la commercialisation. À l’origine de ce problème se trouve un agent pathogène qui réduit considérablement les rendements et menace cette culture vivrière essentielle pour au moins 500 millions de personnes. Il s’agit de la maladie du balai de sorcière du manioc (Cassava Witches’ Broom Disease, (CWBD)), une maladie longtemps restée mal comprise dans une grande partie des zones de production du manioc à travers le monde. Mais cette situation est en train de changer.
Découvrir la cause première : un champignon fastidieux
Au cours des dernières années, les chercheurs de l'Alliance travaillant avec des partenaires nationaux ont confirmé le agent causal du CWBD au Laos : le champignon Ceratobasidium theobromae, et non pas une bactérie comme on le croyait généralement auparavant. Cette découverte, faite par l'équipe de protection des cultures de l'Alliance qui travaille dans notre laboratoire de pathologie situé à l'extérieur de Vientiane et hébergé par l'Institut national de recherche agricole et forestière du Laos (NAFRI), s'est appuyée sur des analyses métagénomiques de l'ADN et des outils de diagnostic avancés, également utilisés pour diagnostiquer le COVID-19, et mis en œuvre par le biais de réseaux de recherche régionaux de longue date.
La technologie Nanopore expliquée dans notre laboratoire au Laos, au début de cette découverte.
Au printemps 2024, en collaboration avec l’ANSES et Fredon en Guyane française, ainsi qu’avec l’Embrapa, la société fédérale brésilienne de recherche agricole, les chercheur.e.s de l’Alliance de Bioversity International et du CIAT ont utilisé des outils similaires pour confirmer la présence de la maladie du balai de sorcière du manioc (CWBD) en Amérique du Sud. Peu après, nous avons établi un projet de collaboration étroite avec l’Embrapa et lancé un plan d’intervention rapide visant à limiter la propagation de la maladie.
« Nous sommes confronté.e.s à une situation d’urgence. Le manioc est un aliment de consommation quotidienne au Brésil. Si les producteur.rice.s, en particulier les nombreuses femmes et communautés autochtones qui en dépendent, n’ont plus accès aux racines de manioc, ils et elles n’auront ni de quoi se nourrir ni de quoi générer des revenus », a déclaré Paulo Melo, chercheur au Bureau des relations internationales de l’Embrapa.
Échange mondial de connaissances pour protéger les récoltes
Comment empêcher une propagation supplémentaire de la maladie du balai de sorcière du manioc (CWBD), en particulier en Amérique latine où les conditions humides favorisent le développement du champignon ? Alors que les plants infectés sont collectés puis détruits par le feu, les chercheur.e.s adaptent les outils de diagnostic moléculaire utilisés en Asie afin que les agent.e.s de vulgarisation agricole et les agriculteur.rice.s puissent également reconnaître les premiers signes de la maladie dans les champs d’Amérique latine. Tous les protocoles développés et validés par l’équipe sont librement accessibles via notre plateforme de surveillance PestDisPlace.
Les partenaires souhaitent démontrer que cette maladie n’est pas un problème localisé, mais une menace qui exige une réponse internationale coordonnée, rendue possible grâce aux échanges de connaissances Sud-Sud. Les capacités de diagnostic et d’amélioration variétale développées grâce à la collaboration entre les chercheur.e.s de Colombie et du Laos sont désormais étendues à travers des réseaux tels que la Société Internationale des Cultures Tropicales à Racines (ISTRC), partout où le manioc constitue un aliment de base pour des centaines de millions de ménages agricoles familiaux. Ces travaux ont bénéficié d’une large couverture médiatique, notamment en Portuguais par la Fondation de Recherche de São Paulo (FAPESP) et à l’échelle internationale par des médias tels que Mongabay. Cette histoire retrace le parcours de la maladie depuis l’Asie du Sud-Est jusqu’à sa première description documentée dans les Amériques. Elle illustre à la fois l’ampleur mondiale de la menace et la portée internationale de la réponse que nous avons mise en place.
Alors que les agriculteur.rice.s signalent de nouveaux cas de maladie du balai de sorcière du manioc, la lutte contre cet agent pathogène se poursuit.
Partager des semences propres
Une ressource essentielle dans cette lutte est la collection de 6 000 variétés diverses de manioc conservées dans la banque de gènes Future Seeds de l’Alliance de Bioversity International et du CIAT. Parmi ces échantillons, collectés en collaboration avec d’autres partenaires de recherche tels que l’Embrapa, pourrait se trouver la solution à la maladie. Parmi les quelque 300 variétés de manioc testées jusqu’à présent, les sélectionneur.euse.s de manioc de l’Alliance ont identifié plusieurs variétés présentant une résistance à la maladie du balai de sorcière en Asie du Sud-Est. Les chercheur.e.s espèrent que cette résistance pourra également s’appliquer à d’autres régions du monde.
« Il est difficile de surestimer l’importance des collections de ressources génétiques de manioc. Elles constituent la base génétique indispensable à la création de nouvelles variétés et à l’identification ainsi qu’à la compréhension des mécanismes naturels de résistance aux maladies. Il est essentiel que le matériel végétal menacé par la maladie du balai de sorcière soit collecté, soumis à des tests de dépistage et rapidement transféré vers des installations de conservation in vitro à des fins de recherche », a déclaré Jonathan Newby, responsable de l’équipe de recherche sur le manioc à l’Alliance de Bioversity International et du CIAT.
Des manuels ont été produits pour faciliter la multiplication du matériel de plantation propre
.
Ce modèle, dans lequel les instituts nationaux de recherche, les sélectionneur.euse.s végétaux.ales, les agences gouvernementales et le secteur privé travaillent de manière concertée sous l’orientation scientifique de l’Alliance de Bioversity International et du CIAT, reflète un principe fondamental de l’approche de l’Alliance : les solutions durables face aux maladies des cultures nécessitent non seulement des connaissances techniques, mais aussi des capacités partagées et des relations institutionnelles construites dans la durée. Les sélectionneur.euse.s disposent désormais d’un accès à des ressources génétiques caractérisées dont les profils de résistance sont connus. Les gouvernements bénéficient de systèmes d’alerte précoce dont ils ne disposaient pas auparavant. Quant aux agriculteur.rice.s, dont les moyens de subsistance dépendent de chaque récolte viable, ils et elles peuvent compter sur des partenaires mobilisés avec urgence pour répondre à cette menace.
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Agriculteur.rice.s africain.e.s
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Variétés de bananes
Sont passés de la banque de gènes Musa de l'Alliance aux champs des agriculteurs.
Wilmer Cuellar
Senior Scientist
Juan Manuel Pardo García
Senior Research Associate
Alejandra Gil-Ordóñez
Research Associate
